Lily Hansen-Gillis สมาชิกทีม LabDAO Core
ซินไบโอเบต้า
โครงการ Folding@home เป็นข่าวพาดหัวตลอดการแพร่ระบาดของ COVID-19 สำหรับการรวบรวมพลังการประมวลผลที่ไม่ได้ใช้งานเพื่อสำรวจพื้นที่ค้นหาการพับโปรตีนเพื่อรับมือกับไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่ การส่งเสริมให้ประชาชนสามารถเป็นนักวิทยาศาสตร์ได้ด้วยตนเอง ความคิดริเริ่มนี้ดำเนินการจำลองขนาดใหญ่ของการกำหนดค่าโมเลกุลของโปรตีนที่แตกต่างกันผ่านเครือข่ายกระจายของคอมพิวเตอร์ที่ "ลงทะเบียน" ทั่วโลก
กระบวนทัศน์แบบกระจายอำนาจนี้ได้รับการประกาศให้นำผู้คนมารวมกันเพื่อแก้ไขปัญหาทั่วไปและพลังการประมวลผลแบบฝูงชนอย่างมีประสิทธิภาพ แต่จะเกิดอะไรขึ้นหากพลังการประมวลผลและโครงสร้างพื้นฐานในการแก้ปัญหากลับกัน กล่าวอีกนัยหนึ่ง จะเกิดอะไรขึ้นถ้าแต่ละคนสามารถดำเนินโครงการของตนเองได้โดยการใช้ประโยชน์จากพลังการคำนวณที่สะสมไว้ และ เครื่องมือสำหรับการทดลองทางชีววิทยาในการบูต?
LabDAO กำลังทำให้ความฝันนั้นเป็นจริงด้วยแพลตฟอร์ม PLEX PLEX เป็นเครื่องมือบรรทัดคำสั่งแบบโอเพ่นซอร์สที่ออกแบบมาเพื่อไม่เพียงสร้างทรัพยากรการประมวลผล แต่ยังรวมถึงเครื่องมือการเรียนรู้ด้วยเครื่องจักรทางชีวภาพที่หลากหลาย (สร้างชุด "BioML" ภายใน LabDAO) สามารถเข้าถึงได้จากภูมิหลังที่หลากหลาย ไม่ว่าจะเป็นการทดลองเชื่อมต่อโมเลกุลขนาดเล็กหรือการจำลองการพับโปรตีนด้วยตนเอง PLEX ช่วยให้ผู้ใช้เข้าถึงคลังเครื่องมือของ LabDAO แชร์ผลลัพธ์ และแสดงภาพได้ภายในเวลาไม่ถึงห้านาที
ชุดเครื่องมือนี้และแพลตฟอร์มที่ใช้งานอยู่ด้านบนได้รับการจัดแสดงในการประชุมสุดยอด Blockchain Meets Biology ของ Zuzalu เมื่อต้นเดือนเมษายน โดย Lily Hansen-Gillis สมาชิกในทีม LabDAO Core ได้สาธิตตั้งแต่ต้นจนจบการจำลองการเปลี่ยนแปลงของโมเลกุลภายในของ a โปรตีนเพื่อค้นหาโครงร่างที่เสถียรที่สุด จากนั้น ในฐานะที่เป็น “ผู้ที่ไม่เขียนโค้ด” เธอจึงแนะนำผู้ชมตั้งแต่ต้นจนจบ โดยใช้คอมพิวเตอร์, WiFi, PLEX บนบรรทัดคำสั่ง และไม่มีอะไรมากไปกว่านั้น
ในวงกว้างยิ่งขึ้น LabDAO เป็นแพลตฟอร์มแบบกระจายอำนาจที่เปิดใช้งาน web3 (ส่วนหนึ่งของขบวนการ "DeSci" ที่ใหญ่กว่า) มุ่งมั่นที่จะสร้างสภาพแวดล้อมที่มีประสิทธิผลมากขึ้นสำหรับการค้นพบยาที่ขับเคลื่อนด้วยโอเพ่นซอร์ส ด้วยการสร้างเครื่องมือและทรัพยากรที่ทันสมัยให้กับระบบนิเวศที่กว้างขึ้น LabDAO มีเป้าหมายที่จะสร้างสภาพแวดล้อมที่เหมาะสมสำหรับความก้าวหน้าทางวิทยาศาสตร์ที่โปร่งใสและเข้าถึงได้ ไม่ว่าจะเป็นการขจัดความจำเป็นที่นักวิจัยจะต้องมีฮาร์ดแวร์หรือโครงสร้างพื้นฐานด้านคอมพิวเตอร์ของตนเอง หรือการเผยแพร่ผลการทดลองบนบัญชีแยกประเภทบล็อกเชนเพื่อให้สามารถติดตามและทำซ้ำได้ องค์กรมุ่งมั่นที่จะสร้างนวัตกรรมให้มากขึ้นผ่านการทำงานร่วมกัน ทำลายอุปสรรคที่เกิดจากผู้ไม่หวังดี ความสามารถในการใช้งานและความเชี่ยวชาญเฉพาะกลุ่ม
ความพยายามของ LabDAO ในการสร้างโลก DeSci แห่งอนาคตสำหรับวันนี้เพิ่งได้รับการส่งเสริมในรูปของรอบการระดมทุน 3.6 ล้านดอลลาร์จาก DAO อื่นๆ, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan และอื่นๆ การสนับสนุนที่หลั่งไหลเข้ามานี้จะนำไปสู่ความพยายามอย่างต่อเนื่องในการสร้างเครื่องมือซอฟต์แวร์โอเพ่นซอร์สและเสริมระบบนิเวศการวิจัยของ LabDAO
สำหรับ PLEX เองนั้น ขั้นตอนต่อไปในขอบฟ้า ได้แก่ การทดสอบแพลตฟอร์มในความร่วมมือทางวิทยาศาสตร์ที่แตกต่างกัน การบรรจุเครื่องมือต่างๆ และการรวบรวมฮาร์ดแวร์ที่จำเป็นเพื่อส่งเสริมเครือข่าย BioML
สำหรับในระยะยาว ยาช่วยชีวิตตัวต่อไประหว่างการระบาดของโรคติดเชื้อครั้งใหญ่ครั้งต่อไปอาจได้รับการออกแบบด้วยพลังของ PLEX ซึ่งเป็นก้าวที่กระจายอำนาจไปข้างหน้าทีละก้าว ในขณะที่ระบบนิเวศยังคงเติบโต เวลาเท่านั้นที่จะบอกได้
ขอบคุณ ไอชานี อาเทรช สำหรับการวิจัยและรายงานเพิ่มเติมเกี่ยวกับบทความนี้ ฉันเป็นผู้ก่อตั้ง SynBioBeta และบางบริษัทที่ฉันเขียนถึงก็เป็นผู้สนับสนุน การประชุม SynBioBeta. สำหรับเนื้อหาเพิ่มเติม คุณสามารถสมัครรับข้อมูล จดหมายข่าวประจำสัปดาห์ของฉัน.
ที่มา: https://www.forbes.com/sites/johncumbers/2023/06/02/labdao-is-charting-the-future-of-open-source-ai-for-drug-discovery/